本品屬三苯甲烷類染料消毒劑，能與微生物酶系統(tǒng)發(fā)生氫離子的競爭性對抗，使酶成為無活性的氧化狀態(tài)，而發(fā)揮殺菌作用。主要對革蘭陽性菌如葡萄球菌、白喉桿菌，以及綠膿桿菌、白念珠菌、表皮癬菌有殺滅作用，對其它革蘭陰性菌和抗酸桿菌幾乎無作用。本品毒性小，對組織無刺激，且能與壞死組織凝結成保護膜，起收斂作用。

有實驗報告表明動物全身性(或系統(tǒng)性)吸收甲紫可致癌，有的國家規(guī)定本品只能用于局部未破損皮膚，嚴禁內服。但目前國內尚未見有關甲紫致癌的不良反應監(jiān)測報告。