藥師如來(lái)在過(guò)去世行菩薩道時(shí),為救度眾生而發(fā)十二大愿(或稱十二上愿)如下:
愿我來(lái)世得阿耨多羅三藐三菩提時(shí),自身光明熾然,照耀無(wú)量無(wú)數(shù)無(wú)邊世界。以三十二大丈夫相、八十隨形好莊嚴(yán)其身,令一 切有情,如我無(wú)異。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),身如琉璃,內(nèi)外明徹,凈無(wú)瑕穢,光明廣大,功德巍巍,身善安住,焰網(wǎng)莊嚴(yán),過(guò)于日月,幽冥眾生,悉蒙開(kāi)曉,隨意所趣,作諸事業(yè)。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),以無(wú)量無(wú)邊智慧方便,令諸有情,皆得無(wú)盡所受用物,莫令眾生有所乏少。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),若諸有情行邪道者,悉令安住菩提道中;若行聲聞、獨(dú)覺(jué)乘者,皆以大乘而安立之。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),若有無(wú)量無(wú)邊有情,于我法中修行梵行,一切皆令得不缺戒,具三聚戒。設(shè)有毀犯,聞我名已,還得清凈,不墮惡趣。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),若諸有情其身下劣,諸根不具,丑陋頑愚、盲聾喑啞、攣躃背僂、白癩顛狂種種病苦,聞我名已,一切皆得端正黠慧,諸根完具,無(wú)諸疾苦。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),若諸有情,眾病逼切,無(wú)救無(wú)歸,無(wú)醫(yī)無(wú)藥,無(wú)親無(wú)家,貧窮多苦,我之名號(hào),一經(jīng)其耳,眾病悉除,身心安樂(lè),家屬資具,悉皆豐足,乃至證得無(wú)上菩提。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),若有女人,為女百惡之所逼惱,極生厭離,愿舍女身,聞我名已,一切皆得轉(zhuǎn)女成男,具丈夫相,乃至證得無(wú)上菩提。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),令諸有情出魔罥網(wǎng),解脫一切外道纏縛;若墮種種惡見(jiàn)稠林,皆當(dāng)引攝置于正見(jiàn),漸令修習(xí)諸菩薩行,速證無(wú)上正等菩提。
愿我來(lái)世得菩提時(shí),若諸有情王法所加,縛錄鞭撻。系閉牢獄。工當(dāng)刑戮及余無(wú)量災(zāi)難凌辱。悲愁前逼。身心受苦。若聞聲名。以我福德威神力故皆得解脫一切憂苦。
愿我來(lái)世。得菩提時(shí)。若諸有情。饑渴所惱。 為求食故。造諸惡業(yè)。得聞我名。專念受持。我當(dāng)天以上妙飲食飽足其身。后以法昧畢竟安樂(lè)。而建立之。
愿我來(lái)世得菩提時(shí)。若諸有情,貧無(wú)衣服,蚊虻寒熱,晝夜逼惱,若聞我名,專念受持,如其所好,即得種種上妙衣服。亦得一切實(shí)莊嚴(yán)具。華鬘涂香,鼓樂(lè)眾伎,隨心所玩,皆令滿足。