安徽中醫(yī)學院與外國高校合作廣泛，安徽中醫(yī)學院與外國高校合作如美國、澳大利亞等16個國家和地區(qū)的30多個醫(yī)療和教育機構(gòu)建立了友好合作關(guān)系。1995年，學校獲準招收國外留學生，2001年，安徽中醫(yī)學院與外國高校合作開始招收碩士學位國外留學生。2002—2009年共選拔了百余名學生赴日本、韓國、瑞典留學就業(yè)。