診斷流行性乙型腦炎（簡稱乙腦）時，常用的輔助檢查主要包括以下幾個方面：
1. 血常規(guī)檢查：乙腦患者在急性期可能會出現(xiàn)白細胞計數(shù)升高，尤其是中性粒細胞比例增加。這有助于初步判斷是否為感染性疾病。
2. 腦脊液檢查：通過腰椎穿刺獲取腦脊液樣本進行分析是診斷乙腦的重要方法之一。典型的改變包括壓力增高、外觀清亮或微渾、白細胞輕度增多（以淋巴細胞為主）、蛋白質(zhì)含量稍高而糖和氯化物正常等。
3. 血清學(xué)檢測：血清特異性IgM抗體陽性是確診乙腦的關(guān)鍵依據(jù)。通常采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)方法測定患者恢復(fù)期與急性期雙份血清中抗乙腦病毒的IgM抗體水平，如果恢復(fù)期血清中的滴度比急性期升高4倍以上，則具有診斷意義。
4. 病毒核酸檢測：利用RT-PCR技術(shù)直接從患者的血液、腦脊液等標本中檢測乙腦病毒RNA，可以快速準確地確定病原體，對早期診斷有重要價值。
5. 影像學(xué)檢查：如CT掃描或MRI成像可顯示大腦皮質(zhì)及基底節(jié)區(qū)的異常改變，對于排除其他疾病和了解病變范圍有一定幫助。但需要注意的是，并非所有乙腦病例都會出現(xiàn)明顯的影像學(xué)變化。

通過上述多種輔助檢查手段結(jié)合臨床表現(xiàn)綜合判斷，可以提高乙腦的確診率。