醫(yī)療機構(gòu)如果違反了衛(wèi)生法規(guī)，將會根據(jù)其違法行為的具體性質(zhì)、情節(jié)輕重以及造成的后果等因素，面臨不同的法律后果和行政處罰。這些處罰措施主要包括但不限于：
1. 警告：對于初次違規(guī)且情節(jié)輕微的醫(yī)療機構(gòu)，衛(wèi)生行政部門可能會首先給予警告，并要求其立即改正。
2. 罰款：針對較為嚴重的違法違規(guī)行為，如未按規(guī)定設(shè)置醫(yī)療廢物處理設(shè)施、違規(guī)發(fā)布醫(yī)療廣告等，相關(guān)機構(gòu)會被處以一定數(shù)額的罰款。罰款金額依據(jù)違法行為的具體情況而定。
3. 停業(yè)整頓：如果醫(yī)療機構(gòu)存在重大安全隱患或嚴重違反衛(wèi)生管理規(guī)定的行為，并且在限期內(nèi)未能有效整改，則可能被要求停業(yè)整頓一段時間，直至問題得到解決。
4. 吊銷執(zhí)業(yè)許可證：對于那些屢教不改或者造成極其惡劣社會影響的醫(yī)療機構(gòu)及其負責人，將依法吊銷其《醫(yī)療機構(gòu)執(zhí)業(yè)許可證》，禁止其繼續(xù)從事醫(yī)療服務活動。
5. 刑事責任追究：當醫(yī)療機構(gòu)的行為觸犯了刑法，如非法行醫(yī)、故意傷害患者等，則不僅會遭受上述行政處罰，相關(guān)責任人還可能被依法追究刑事責任。

總之，為了保障人民群眾的生命健康安全和維護良好的醫(yī)療秩序，國家對醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域的監(jiān)管非常嚴格。作為中醫(yī)執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師，在日常工作中應當嚴格遵守各項衛(wèi)生法規(guī)，確保自身及所在機構(gòu)的合法合規(guī)運營。