根莖是地下莖的總稱，包括根狀莖、塊莖、球莖及鱗莖等，其顯微鑒別要點(diǎn)主要從組織構(gòu)造和粉末特征兩方面來(lái)把握。

從組織構(gòu)造來(lái)看，首先要區(qū)分雙子葉植物根莖和單子葉植物根莖。雙子葉植物根莖一般具木栓層，有的有表皮。如黃連根莖有木栓層，而少數(shù)根莖為次生構(gòu)造不發(fā)達(dá)的初生構(gòu)造，無(wú)木栓層而有表皮，如升麻。皮層中常有根跡維管束和葉跡維管束斜向通過(guò)。維管束大多為無(wú)限外韌型，少數(shù)為雙韌型，多呈環(huán)狀排列，束間被髓射線分隔。中央有髓部，這是雙子葉植物根莖的典型特征之一。異常構(gòu)造也較為常見(jiàn)，如大黃根莖，其髓部有異型維管束。

單子葉植物根莖通常有表皮或木栓化皮層細(xì)胞。皮層寬廣，常有葉跡維管束散在。內(nèi)皮層大多明顯，具凱氏帶。維管束為有限外韌型或周木型，散列分布，無(wú)髓部。比如石菖蒲根莖，就具有典型的單子葉植物根莖的組織構(gòu)造特征。

蕨類植物根莖的組織構(gòu)造與雙子葉、單子葉植物根莖有所不同。其表皮通常為一列外壁加厚的細(xì)胞。皮層發(fā)達(dá)，內(nèi)皮層明顯。中柱類型多樣，有原生中柱、管狀中柱、網(wǎng)狀中柱等。例如綿馬貫眾根莖為網(wǎng)狀中柱。

從粉末特征來(lái)看，根莖粉末中常見(jiàn)的細(xì)胞組織有厚壁組織，如纖維、石細(xì)胞等，它們的形狀、大小、壁的厚度及紋孔等特征對(duì)鑒別有重要意義。導(dǎo)管也是重要的鑒別特征，不同類型的導(dǎo)管，如環(huán)紋、螺紋、梯紋、網(wǎng)紋和孔紋導(dǎo)管，其出現(xiàn)頻率和形態(tài)特點(diǎn)可用于區(qū)分不同的根莖類藥材。此外，根莖中還可能含有淀粉粒、草酸鈣結(jié)晶等，淀粉粒的形狀、大小、臍點(diǎn)和層紋情況，草酸鈣結(jié)晶的類型（如簇晶、針晶、方晶等）及存在狀態(tài)，都能為根莖的鑒別提供重要線索。

根莖的顯微鑒別要點(diǎn)涵蓋了組織構(gòu)造和粉末特征的多個(gè)方面，通過(guò)綜合觀察和分析這些特征，能夠準(zhǔn)確地鑒別不同的根莖類藥材。