當(dāng)鄉(xiāng)村全科執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師在工作中遇到突發(fā)事件時，正確的做法是立即向上級衛(wèi)生行政部門或當(dāng)?shù)丶膊☆A(yù)防控制機(jī)構(gòu)報告。根據(jù)《中華人民共和國突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急條例》的規(guī)定，任何單位和個人發(fā)現(xiàn)突發(fā)公共衛(wèi)生事件，應(yīng)當(dāng)及時向所在地縣級人民政府衛(wèi)生行政主管部門或者其指定的專業(yè)機(jī)構(gòu)報告。對于鄉(xiāng)村醫(yī)生而言，通常首先應(yīng)該聯(lián)系的是鄉(xiāng)鎮(zhèn)衛(wèi)生院或是縣（區(qū)）級的衛(wèi)生行政部門和疾病預(yù)防控制中心。

具體操作流程如下：
1. 第一時間確認(rèn)突發(fā)事件性質(zhì)，確保信息準(zhǔn)確無誤。
2. 盡快通過電話、網(wǎng)絡(luò)等有效方式與上述部門取得聯(lián)系，并簡明扼要地報告事件情況，包括時間、地點、涉及人數(shù)及初步判斷的原因等關(guān)鍵信息。
3. 按照上級指示采取必要的應(yīng)急措施，如現(xiàn)場隔離、初步救治等工作。
4. 記錄整個過程中的重要環(huán)節(jié)和處理結(jié)果，為后續(xù)調(diào)查提供依據(jù)。

此外，在日常工作中，鄉(xiāng)村醫(yī)生也應(yīng)當(dāng)加強(qiáng)與當(dāng)?shù)匦l(wèi)生部門的溝通聯(lián)系，熟悉突發(fā)事件上報流程，確保一旦發(fā)生緊急狀況能夠迅速響應(yīng)并妥善處置。