主要癥狀為嘔吐、腹脹和便秘。

嘔吐：高位腸閉鎖嘔吐多于第1次喂奶后或生后第l天出現(xiàn)，而低位閉鎖于生后2～3天出現(xiàn)。嘔吐呈進行性加重。高位腸閉鎖的病兒嘔吐物為奶塊，多含有膽汁。低位閉鎖嘔吐物可呈糞便樣并帶臭味。

腹脹：閉鎖的位置越低、就診時間越晚，腹脹程度就越重，反之則較輕。高位閉鎖的腹脹僅限于上腹部。低位閉鎖全腹呈一致性膨脹，進行性加重。高位腸閉鎖時偶爾在上腹部可見胃型。低位腸閉鎖時往往可見到擴張的腸袢。

出生后無正常胎糞排出，有的僅排出少量灰白色或青灰色黏液樣物。

最初病兒全身情況尚好，由于嘔吐頻繁，很快出現(xiàn)脫水，全身情況迅速惡化。如同時有腸穿孔腹膜炎，腹脹更加明顯，腹壁水腫發(fā)紅，同時有呼吸困難和中毒癥狀。