多肽鏈形成二級(jí)結(jié)構(gòu)的過(guò)程主要依賴(lài)于分子內(nèi)部氨基酸殘基之間的氫鍵作用。在蛋白質(zhì)的多肽鏈中，每個(gè)氨基酸都通過(guò)肽鍵相連，而肽鍵具有部分雙鍵性質(zhì)，這使得相鄰的肽單元之間能夠以特定的角度旋轉(zhuǎn)，從而產(chǎn)生不同的構(gòu)象。

二級(jí)結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)主鏈按照一定的規(guī)律折疊形成的局部空間結(jié)構(gòu)，主要包括α-螺旋、β-折疊和轉(zhuǎn)角等幾種類(lèi)型。這些結(jié)構(gòu)的形成主要由以下因素決定：
1. 氫鍵：在α-螺旋中，每個(gè)氨基酸殘基上的羰基氧與第四個(gè)氨基酸殘基上的氨基氫之間形成氫鍵；而在β-折疊結(jié)構(gòu)中，則是相鄰多肽鏈間或同一條多肽鏈上不同段落間的相應(yīng)位置的羰基氧和氨基氫之間形成氫鍵。這些氫鍵的存在穩(wěn)定了二級(jí)結(jié)構(gòu)。
2. 氨基酸序列：不同的氨基酸側(cè)鏈具有不同的物理化學(xué)性質(zhì)，如親水性、疏水性等，這會(huì)影響蛋白質(zhì)采取何種二級(jí)結(jié)構(gòu)。例如，含有較多帶電荷或極性的氨基酸殘基傾向于形成α-螺旋；而含有大量非極性和芳香族氨基酸的區(qū)域則更可能形成β-折疊。
3. 環(huán)境因素：溶液條件（如pH值、離子強(qiáng)度等）也會(huì)影響多肽鏈采取何種二級(jí)結(jié)構(gòu)。例如，在酸性條件下，某些蛋白質(zhì)可能會(huì)失去其天然構(gòu)象并重新折疊成不同的二級(jí)結(jié)構(gòu)。

綜上所述，多肽鏈通過(guò)內(nèi)部氫鍵的作用以及氨基酸殘基的物理化學(xué)性質(zhì)和外界環(huán)境條件的影響來(lái)形成穩(wěn)定的二級(jí)結(jié)構(gòu)。這些局部有序排列為后續(xù)更高層次的三級(jí)、四級(jí)結(jié)構(gòu)提供了基礎(chǔ)。