正黏病毒和副黏病毒是兩類不同的病毒，它們在多個方面存在區(qū)別。

在病毒形態(tài)方面，正黏病毒一般呈球形或絲狀，病毒顆粒相對較小，直徑約為80 - 120納米；而副黏病毒多為球形，形態(tài)大小差異較大，直徑通常在150 - 300納米，比正黏病毒大。

基因組結構上，正黏病毒的基因組為分節(jié)段的單股負鏈RNA，一般有8個節(jié)段。這種分節(jié)段的特點使得病毒在復制過程中容易發(fā)生基因重配，導致新的病毒株出現(xiàn)，這也是流感病毒容易發(fā)生抗原轉(zhuǎn)變的原因。副黏病毒的基因組是單股負鏈RNA，但為不分節(jié)段的完整一條，相對較為穩(wěn)定，抗原性變異頻率低于正黏病毒。

抗原特性上，正黏病毒的表面抗原如血凝素（HA）和神經(jīng)氨酸酶（NA）具有高度變異性，這使得人體免疫系統(tǒng)難以對其產(chǎn)生持久有效的免疫保護，所以正黏病毒引起的疾病如流行性感冒容易反復流行。副黏病毒的抗原性相對穩(wěn)定，例如麻疹病毒、腮腺炎病毒等，感染后人體可獲得較為持久的免疫力。

致病特點方面，正黏病毒主要引起流行性感冒，具有傳播速度快、發(fā)病率高、容易引起大流行等特點，嚴重時可導致肺炎等并發(fā)癥甚至危及生命。副黏病毒可引起多種疾病，如麻疹病毒引起麻疹，腮腺炎病毒引起流行性腮腺炎，呼吸道合胞病毒引起嬰幼兒呼吸道感染等，不同的副黏病毒致病表現(xiàn)各有特點，但一般不像正黏病毒那樣容易引發(fā)大規(guī)模的全球性流行。

培養(yǎng)特性上，正黏病毒可以在雞胚中良好生長，常用于病毒的分離和培養(yǎng)。副黏病毒有些可以在雞胚中生長，但部分病毒更適合在組織培養(yǎng)細胞中培養(yǎng)，如呼吸道合胞病毒常用人胚腎細胞等進行培養(yǎng)。