嘧啶核苷酸的分解終產(chǎn)物與嘌呤核苷酸不同。嘧啶核苷酸的分解代謝過程是一個(gè)逐步降解的過程。

首先，在核苷酸酶及核苷磷酸化酶的作用下，嘧啶核苷酸會(huì)脫去磷酸及戊糖，生成嘧啶堿。對(duì)于不同的嘧啶堿，其分解途徑有所差異。

胞嘧啶（C）首先會(huì)經(jīng)脫氨基作用轉(zhuǎn)化為尿嘧啶（U）。尿嘧啶的分解是先在二氫尿嘧啶脫氫酶的催化下，加氫還原生成二氫尿嘧啶，然后在二氫尿嘧啶酶的作用下，開環(huán)生成β - 脲基丙酸，接著在β - 脲基丙酸酶的催化下進(jìn)一步分解，最終生成二氧化碳（CO?）、氨（NH?）和β - 丙氨酸。

胸腺嘧啶（T）的分解過程也是先還原，在二氫胸腺嘧啶脫氫酶的作用下還原為二氫胸腺嘧啶，之后二氫胸腺嘧啶在二氫胸腺嘧啶酶作用下開環(huán)，生成β - 脲基異丁酸，再經(jīng)過β - 脲基異丁酸酶的作用，最終分解產(chǎn)生二氧化碳（CO?）、氨（NH?）和β - 氨基異丁酸。

所以，嘧啶核苷酸分解的終產(chǎn)物主要是二氧化碳、氨、β - 丙氨酸和β - 氨基異丁酸。與嘌呤核苷酸分解終產(chǎn)物尿酸不同，嘧啶堿的分解產(chǎn)物均易溶于水。其中，β - 氨基異丁酸可隨尿液排出體外，臨床上通過檢測(cè)尿液中β - 氨基異丁酸的含量，有助于某些疾病的診斷，例如白血病患者尿液中β - 氨基異丁酸的排出量會(huì)增加。而β - 丙氨酸還可以參與體內(nèi)泛酸等物質(zhì)的合成，繼續(xù)發(fā)揮其生理作用。