肽鍵的形成主要發(fā)生在蛋白質(zhì)合成的過程中，即翻譯階段。這個(gè)過程中最關(guān)鍵的酶是核糖體上的兩種活性中心，分別是A位點(diǎn)（氨?；?tRNA受體）和P位點(diǎn)（肽酰基-tRNA受體），但它們并不是傳統(tǒng)意義上的“酶”，而是通過結(jié)構(gòu)功能來促進(jìn)肽鍵的形成。真正催化肽鍵形成的是一種被稱為肽酰轉(zhuǎn)移酶（Peptidyl transferase）的活性，這種活性是由核糖體大亞基中的rRNA分子提供的。

具體來說，在蛋白質(zhì)合成過程中：
1. 氨酰-tRNA結(jié)合到核糖體上的A位點(diǎn)。
2. 在肽酰轉(zhuǎn)移酶的作用下，位于P位點(diǎn)的肽?；鶊F(tuán)與A位點(diǎn)上氨酰-tRNA攜帶的氨基酸之間發(fā)生反應(yīng)形成新的肽鍵。
3. 形成肽鏈后，肽鏈連同tRNA移動(dòng)至P位點(diǎn)，而空載的tRNA則從P位點(diǎn)釋放出去。

因此，在肽鍵形成的直接過程中，并沒有單一的具體酶參與催化作用，而是由核糖體特別是其大亞基中的rRNA分子所具有的肽酰轉(zhuǎn)移活性來完成這一過程。不過，在整個(gè)蛋白質(zhì)合成的過程中，還有許多其他類型的酶和因子（如氨酰-tRNA合成酶、翻譯起始因子等）發(fā)揮著重要作用。